Одними из наиболее трудно диагностируемых а современной терапевтической стоматологии являются заболевания слизистой оболочки полости рта. Это обусловлено многообразием заболеваний, неясностью этиологии и патогенеза и значительным сходством клинических проявлений различных нозологических форм. В настоящее время ни у кого не вызывает сомнений связь многих патологических процессов в полости рта с заболеваниями различных органов и систем организма, нарушениями обменных процессов, изменениями имунного статуса и нервной системы. Все это диктует необходимость комплексного подхода к диагностике и терапии заболеваний слизистой оболочки полости рта. 
 Установить такую связь может специалист, который занимается диагностикой и лечением заболеваний слизистой оболочки полости рта, владеющий нетрадиционными методами диагностики и лечения 
(рефлексотерапия, диагностика по Фоллю, гомеопатия и т.д.). Опытные стоматологи могут по лакализации афт определить в каком органе могут быть проблмы и направить на обследованием, но все это достаточно сложно.